| 1 | TBS靶向甲基化测序及分析 | 艾斯 | 科学研究和试验开发 | 艾斯
| 1.00
| 项 | 否 |
|
规格配置：81个人样本靶向区域进行基于Acegen Targeted Methyl Panel系统的亚硫酸盐测序PCR引物设计，每个基因至少设计一个扩增子，结合高通量测序进行检测，每个样本的位点/区域测序平均深度不低于200X。
2. 技术内容：
1）引物设计：对目标序列/位点进行靶向区域甲基化Panel设计（Methyl Targeted Panel）, 扩增子有效扩增目标区域 不低于80%，扩增子长度一般为100-300bp长度范围。
2）建库测序：对每个样本进行Methyl Targeted Panel建库，测序平台为PE150测序
3) 信息分析:
分析内容 信息分析条目 Note
基础分析1 1去接头污染，去低质量reads和产量情况统计
2 Bisulfite信息采集序列与参考基因组目标序列的比对
基础分析2 3C碱基深度和覆盖度分析
4 C碱基的甲基化水平统计
5不同样本间基因甲基化水平比较
在筛选确定的基因启动子区域进行BSP引物设计合成及验证； |
售后服务：1. 乙方在甲方筛选确定的基因启动子区域进行BSP引物设计合成及验证；
2. 乙方应在 30 个自然日(PCR引物设计与检查合格及样本检测合格开始计算)完成所有样品的建库和测序工作；
3. 乙方在工作完成后向甲方提供项目所有原始测序数据； |
更多
